أسس متحف أثار السلط في مبنى الطوقان، احدى أعرق الأبنية التي تطل على المركز التجاري لمدينة السلط. بني المبنى عام 1905 وكان منزل لعائلة طوقان وهو مثال للنمط الهندسي المميز لمدينة السلط الذي ظهر اواسط القرن التاسع عشر. في منتصف الخمسينيات تم تحويل المبنى الى مدرسة ومن ثم حول الى متحف عام 1983 ليصبح بمثابة متحفاً إقليمياً لمنطقة البلقاء. بالرغم أن بلدية السلط رممت المتحف في التسعينات، الى انه صدر قرار عن دائرة الأثار في السلط بترميم المتحف في ال 2007 بالتعاون مع السفارة الهولندية.

يعرض في المتحف مجموعة من القطع الفخارية التي تعود إلى العصر الحجري النحاسي بالإضافة الى قطع أثرية نادرة من العصور الرومانية والبيزنطية والإسلامية. يشمل المتحف قاعة تعرض قطع من الفسيفساء التي وجدت في أرضية كنسية بيزنطية وقاعة مخصصة لمجموعة من الصور الفوتوغرافية لنماذج من بيوت السلط والاحياء والاسواق القديمة في السلط.